La Directive Cadre sur l’eau fait apparaitre comme obligation le rétablissement de la continuité écologique sur les cours d’eau classés "à grands migrateurs" et ceux qui pourraient le devenir. Le saumon, l’alose, la lamproie, la truite, l’anguille, qui sont des poissons migrateurs, sont très sensibles à la qualité de l’habitat et en particulier pour se reproduire.
Pour en savoir plus consultez la rubrique vie aquatique : Importance des caractéristiques du milieu pour les espèces.

Différents aménagements sont donc nécessaires afin d’augmenter la capacité d’accueil du milieu pour les poissons :

• mise en place d’ouvrages telles que les passes à poissons : les passes à poissons permettre aux poissons de franchir des obstacles artificiels.
  
• mise en place de divers habitats :
  • de frayères,
  • de caches sous berges où ils peuvent se reposer, s’abriter,
  • de déflecteurs qui diminuent la section d’écoulement et contribuent à la diversification des habitats (création de fosses par exemple) et des écoulements
  • de seuils qui créent des petites chutes d’eau qui favorisent l’oxygénation du milieu et maintiennent une hauteur d’eau adéquate pour le développement des juvéniles. Les seuils vont également favoriser le développement de fosses à l’aval (zones refuges potentielles)
    
• Le fond doit présenter certaines particularités pour que les femelles viennent pondre :
  • Un lit de galets ou de graviers stables pour éviter un déplacement trop important des œufs en cas de crue.
  • La granulométrie doit être adaptée pour que les femelles puissent creuser un trou et y mettre leurs œufs
  • La hauteur d’eau, la vitesse du courant et l’oxygénation sont également des facteurs importants.

Les barrages doivent également être aménagés afin que les poissons puissent les franchir en remontant la rivière.

Il ne faut pas oublier les aménagements complémentaires afin de lutter contre les espèces exotiques envahissantes qui perturbent les hydrosystèmes et ont un impact important sur la biodiversité indigène.
Pour en savoir plus, consultez la rubrique "suivi et protection des milieux aquatiques" : les espèces invasives

Afin d’améliorer la qualité des écosystèmes aquatiques et de diversifier les habitats certaines règles sont à respecter :

• Modifier le moins possible la morphologie du cours d’eau
• Ne pas artificialiser les berges et le fond
• Reconnecter les bras morts
• Respecter les liaisons fonctionnelles entre le cours d’eau et les annexes hydrauliques (prairies, parcelles riveraines
• Diversifier les écoulements

Sommaire

• Améliorer ou préserver les fonctions des cours d’eau
• Des interventions sur les berges et les ripisylves