Il n’existe pas de classes de qualité prédéfinies pour les zones humides.
En Poitou-Charentes, les zones humides sont soumises à de nombreuses dégradations dont l’eutrophisation, due en partie à une mauvaise qualité des eaux superficielles, la qualité de l’eau pouvant se dégrader d’amont en aval du réseau hydrographique. Elles sont aussi soumises à des problèmes :
En outre, les zones humides sont des lieux d’enjeux multiples et jouent un rôle majeur dans la régulation du régime des eaux ou l’épuration des eaux. Dans les cas extrêmes, les dégradations de zones humides conduisent à des risques d’inondations ou de sécheresses accrus, à une épuration naturelle des eaux réduite et à une détérioration des milieux naturels.
Il est estimé qu’en un demi-siècle, les deux tiers des zones humides ont disparu de France (Dupieux 1998).